在行星Zi上，一心希望成為象父親那樣成為優秀的zoids機師的少年邦，同歐卡諾伊多（Organoid） 奇克和神秘少女菲妮一起踏上找尋zoids eve的旅途，並粉碎了帝國首相普羅因茲企圖控制帝國， 佔領共和國的野心。四年後，邦、菲妮都已經長大。為了對抗日益猖獗的使用zoids的恐怖活動， 共和國和帝國合作組織了一支由兩國精英構成的特殊部隊——守護者力量（Guardian Force）。 邦、菲妮又開始一起的旅程，陪伴他們的還有以前的夥伴……
