獨眼少年皐月驅在五年前一場不明原因的自殺中失去了唯一的姐姐。皐月驅從此一蹶不振，幸虧有和他一起長大的水奈瀬由佳的照顧，皐月驅慢慢恢復了平靜的心態，但是他從此對任何人和事都不再關心，對未來也不再抱有任何希望，終日渾渾噩噩的渡日。就這樣兩人進入了新興都市綾女丘市虹陵館學園就讀，由佳一如既往的照顧著驅，兩人的關系也再無進展，然而命運弄人，在毫無征兆的情況下，世界改變了。漆黑的月如墨一樣照耀著大地，空中被染上血色，街道上人的氣息消失了，寂靜包圍了這個無人的廢墟一樣的世界。在這個發生了翻天覆地變化的世界裏，只有驅和由佳被籠罩在巨大的黑色月光底下，街道上的異形蠢蠢欲動，驅和由佳除了逃跑別無選擇。然而，在經過一個特定的時間之後，世界又恢復了原狀。如此往復，“赤夜”的每次來臨都毫無征兆。漸漸的，驅和由佳發現除了他們之外，還有別的人也被卷入了“赤夜”之中。他們有的利用陰陽道擊退敵人，有的利用超越人類的戰鬥能力打敗異形。驅和由佳在“赤夜”相遇的夥伴均是一些有著特殊能力的超能力者。然而，他們將面對更強大的敵人——六個比起其他異形有著更強大戰鬥力的“黑騎士”。盡管驅和他的夥伴為著不通的理由而戰鬥，然而在一起度過校園生活，一起共同戰鬥的過程中，漸漸的，驅和新的夥伴建立了不可取代的關系。經歷了重重戰鬥，面對“赤夜”的真相，驅和他的夥伴們究竟將如何選擇……
